不仅要从精神上控制信徒，更要从组织上控制"法轮功"体系。他在制定出《中国法轮功章程》之后，随即又制定了《对法轮大法辅导站的要求》、《法轮大法弟子传法传功规定》、《法轮大法修炼者须知》。据原"法轮功"骨干揭发材料显示，为加强各级辅导站之间横向联系和纵向指挥，李洪志要求"法轮功"组织内部经常召开集体学法交流会即法会，实际上就是对各级骨干和辅导员进行培训和掌握控制，以达到其扩大和巩固组织的目的。在"法轮功"被中国政府依法取缔之前，李洪志的指令是通过"法轮大法研究会"层层传达的。他曾说"我不在的时候研究会的指令就是我的意思"。即便其本人远在国外，国内信徒也会不断收到"法轮大法研究会"以最高机构名义转发的被称作其"经文"的指令。1998年５月 ，李洪志及其"法轮功"邪教组织煽动千余名信徒围攻北京电视台，北京总站的一名骨干成员因对此次活动态度不积极而被免职。逃到美国以后，李洪志对信徒的指令通常是经"法轮功"媒体"明慧网"发布，他也曾经说过"重大问题看明慧网"。可到后来为保证所发"经文"不"出偏"，创建"明慧网"的"二师父"叶浩竟被李洪志发配到纽约街头打坐"练摊"。李洪志口口声声要弟子"去执著"，而自己的"执著心"在权力面前还是显得这么重，让人无论如何都看不出"法轮功"管理上的"松散"。