李洪志在北京设立了"法轮大法研究会"，自任会长。此后，又陆续在各省、自治区、直辖市设立了三十九个"法轮功"辅导总站，总站下又分设了一千九百多个辅导站、两万八千多个练功点，自上而下形成了一个完整的组织系统。李洪志作为"法轮功"的最高头目，经常通过其组织系统发布指令。 
　　 "法轮大法研究会"及各地总站定期或不定期地组织各种大规模活动，还多次策划、煽动众多"法轮功"修炼者有组织地围攻新闻出版单位和党政机关，严重影响了这些部门的工作秩序和社会秩序。